报告题目：基于单细胞蛋白质组学的细胞类型反卷积方法
主讲人： 汪国华教授，东北林业大学计算机与控制工程学院院长
报告时间：2023年12月11日（星期一）10:30-12:00
报告地点：厦门大学翔安校区西部片区bwin必赢1号楼108
报告摘要：
细胞类型反卷积是一种从批量测序数据中解析细胞类型比例的计算方法，经常用于分析肿瘤组织样本中不同细胞类型占比对疾病发展及临床诊断等方面的影响。然而，由于现有方法的复现性较差、不同组学之间参考标准的差异以及单细胞蛋白质组参考数据的缺乏等方面的挑战，解析蛋白质组数据细胞类型比例的反卷积技术仍处于起步阶段。因此，针对蛋白质组数据的特性，我们开发了一种新的基于深度学习框架的反卷积方法⸺ scpDeconv，使用自编码器利用批量蛋白质组数据中的信息来提高单细胞蛋白质组数据的质量，并使用域对抗训练来拉近单细胞数据和批量数据在隐空间上的分布，进而准确地将单细胞参考数据的标签迁移到目标批量数据。经过丰富的模拟验证实验以及定性分析实验，我们证明了scpDeconv对不同物种/不同蛋白质组技术产生的蛋白质组数据进行细胞类型反卷积的性能，并且证明了scpDeconv广泛应用于肿瘤微环境解析、临床诊断、疾病分类等领域的潜力。
报告人简介：
汪国华，博士，教授，东北林业大学计算机与控制工程学院院长。主持国家杰出青年科学基金等 5项国家自然科学基金项目，国家重点研发计划“BT 与 IT 融合”专项项目负责人。国家自然科学基金委信息学部、生命学部、交叉学部生物信息学方向涵评、会评专家。在Nature Machine Intelligence、Nature Communications、Nature Protocols、Nucleic Acids Research和 Bioinformatics等期刊发表论文80余篇。5篇入选ESI高被引论文。现任中国计算机学会生物信息学专委会常务委员；中国人工智能学会生物信息学与人工生命专委会委员；中国细胞生物学学会功能基因组信息学与系统生物学分会理事。获评教育部新世纪优秀人才，获黑龙江省自然科学二等奖，教育部自然科学二等奖。
邀请人：计算机科学与技术系 王连生教授